據1月31日衛生部公佈的數字顯示，自2005年以來，全國除福建省、海南省和西藏自治區外，其餘各省均有病例報告，其中發病前五位的省份分別為：安徽、河南、河北、江蘇、四川。

據中央社報道，研究數據顯示，中國每年流腦病人中，有一部分已事先接種過疫苗，但後來還是發病，甚至引發嚴重結果。有關專家表示，這有可能是兩種情況導致，一方面是患者在接種疫苗前已感染上流腦細菌，只是還未發病，因為流腦細菌有一天至七天的潛伏期，而疫苗接種後要七天才能發揮作用，在這一交叉時期，流腦細菌就可能發威。另一種可能是流腦疫苗保護率僅百分之八十五，疫苗可能對患者沒有產生作用。

在全國發生流腦疫情的同時，2月2日中國國家質檢總局緊急通知各地檢驗檢疫機嚴防禽流感入境。據報道，越南全國超過半數省份出現禽流感疫情，此外，今年伊始新一輪禽流感疫情中，已經有十三人在越南死亡，其中包括一名柬埔寨婦女。二月三日越南農業部官員已正式要求世界衛生組織和糧農組織提供設備、協助監督以及其它形式的援助，以抗擊禽流感。

報道說，世界衛生組織發言人湯普森日前在日內瓦表示，近一年來，越南和泰國共發現五十五人感染了禽流感病毒，四十一人死亡；而其中在越南，就有十三人在近一個月內死於禽流感。事實證明，禽流感H5N1病毒非常有可能變異成為可以在人際間傳播的病毒。世衛組織對此十分擔憂。

2004年初，禽流感在短短的幾天內席捲中國大陸涉及 15 個省份。廣西、湖北、湖南、安徽、廣東、上海、新疆、浙江、雲南、河南、甘肅、陝西、江西、天津和西藏發生禽流感疫情的有 41 個縣。

流腦疫情已經引起人們的恐慌。禽流感又在向人際傳播的臨界點上。自從SARS在中國發生後，人畜瘟疫不斷。