瑤姬喜歡遊玩。一日，她來到巫山上空，不禁為其秀美的景色吸引。不料，有十二條蛟龍正在此興風作浪，使當地雲雨茫茫。瑤姬決心為人間除去惡龍。於是她手指蛟龍，施展法術。但聞驚雷滾滾，地動山搖。風平浪靜後，十二條蛟龍已然化作了十二座大山。

這十二座大山堵住了巫峽，壅塞了長江，四周汪洋一片。為了治理水患，人間司職治水的大禹趕到此地。然而，這裡山勢高，水勢急，治水十分不容易。大禹日夜憂愁。

瑤姬為大禹治水的精神所感動，便派侍女傳授給他一些法術，同時，還派六位侍臣，施展仙術，疏導了三峽水道，讓洪水暢通東海。大禹十分感謝神女瑤姬的幫助，就登上巫山，當面致謝。

大禹上到巫山之頂，見到了在游龍、彩鳳、白鶴等簇擁下的瑤姬。瑤姬說：「你治水有功，但還要懂得天地間事物變化的道理。」說完，又贈予大禹一部治水用的黃綾寶卷。大禹得了天書，拜謝而去。

水患治理後，瑤姬繼續留在巫山過她的神仙日子。她喜歡變幻成一座秀麗挺拔的山峰，長久的佇立在巫山上觀看日出日落，欣賞這美景。她的侍從也化作了一座座山峰，靜靜的守衛在神女的身旁。

至今，在今天四川巫山一帶，還流傳著由瑤姬幻化的神女峰的傳說。當地百姓尊稱瑤姬為「妙用真人」，還在飛鳳峰山麓，為她修建了一座凝真觀（即神女廟）。山腰上的一塊平台，即神女向夏禹授書的授書台。