巍山是雲南著名的道教名山。早在東漢時期，張道陵天師創立的五斗米道就曾傳入巍山。三國時期，孟獲的兄長孟優得到異人傳授的仙書，在巍山隱居修行，後以方術濟人。《新纂雲南通志・釋道傳》載：「漢，孟優，蒙化人，居巍寶山，土帥孟獲兄也。素懷道念，常往來瀾滄、瀘水間，得異人長生久視方藥諸書，隨處濟人。後主建興三年，諸葛亮南征，軍中誤飲啞泉，輒手足四禁不語，或謂優有良藥，使人往求之。優進仙草立驗，亮驚異之，與語人：天運會深有契。後入峨眉山，不知所終。其子孫於元時，賜姓孟。」根據現存資料，巍山道教在唐朝時興起。唐初，洱海地區出現「六詔」，其中的蒙捨詔在巍山境內，而且在五詔的南部，所以又稱「南詔」。《巍寶山志》記載，太上老君降臨巍山，點化細奴羅，告訴他將成為南詔王。在其死後，還將他封為巍山的巡山王。此後，巍山道教開始發展。唐朝著名道士杜光庭曾來此修煉，並寫了《南詔德化碑》。唐末五代八仙之一的呂洞賓也曾來到巍山傳道。

明清時期，巍山道教走向興盛，眾多道士來此修行，如沈妙章、陳道體、李法紀、楊法印、毛法升、楊法蔭、楊陽合、楊陽慧、李載奇、陳永林、劉志法、鄭心元等。《雲南通志》卷二十五記錄了一些道士的故事。比如明朝的王旻，四川華陽人。永樂初年，在蒙化居住時，遇到異人傳授其道術。學後，他能役使鬼神，召喚風雨。當時鄧川有一條惡龍作祟，人們請王旻前往驅惡。王旻來到後，惡龍遁去。成化十年，他預先知道了自己坐化的日子，告訴了大家。到了那一天，他果然仙去。蒙化人都認為他屍解成仙了。還有清代的知名道士何太和、馮應魁也在巍山隱居修行。史料記載，鼎盛時期住山道士多達數百人。

唐之前，巍山中已經建有山神廟、龍王廟等廟宇，宮觀則自唐開始修建，唐代南詔王族的後裔們在山上修建了老君殿；明清時則開始大量建造宮觀，至清末，道教殿宇已然遍佈全山，多達二十餘所，其中歷史最為悠久的是懸珠觀。它「創自蒙詔，明成化（1465∼1487）間拓建，為近城諸剎之冠」；觀內有關聖殿、玉皇閣、三官殿、天王殿、呂祖殿、財神殿、天師樓等建築。民國時期，因為和與其相鄰的另一佛寺聯通，故又稱玄龍寺。此外，著名的宮觀還有准提閣、巡山殿、文昌宮、青霞觀、玉皇閣、培鶴樓、含真樓、元極宮、雲鶴宮、道源宮等。建於明代的青霞觀內有《重修巍山青霞觀碑記》，云：此地是道教始祖太上老君降化細奴羅之所。建於乾隆時期的培鶴樓，是祭祀呂洞賓之所。其為一巍峨壯觀的大殿，內奉呂純陽祖師，泥像身披綠袍八卦衣，頭戴方巾帽，身後塑有兩隻仙鶴，傳說這兩隻仙鶴是建蓋培鶴樓時從地基上飛出。

除了道士在巍山上修煉外，還有僧人亦在此修行。唐代中期，佛教傳入巍山，並建造了觀音殿、甘露亭等寺院。

巍山除了與修煉有關而留下的「巍寶仙蹤」外，還有八大自然勝景，即拱城遠眺、天門鎖勝、美女瞻雲、龍池秋月、山茶流紅、鶴樓古梅、朝陽育鶴和古洞長春。此外，每年農曆二月十三日至十五日的巍山歌會， 是彝族青年男女的狂歡節。

清張端亮有詩讚美了巍山的自然和人文景觀：